O Ιωάννης Παπαπαναγιώτου γεννήθηκε στην Πάτρα το 1921. Oλοκλήρωσε τις γυμνασιακές του σπουδές στην Αμαλιάδα και φοίτησε στην Ιατρική Σχολή του Πανεπιστημίου Αθηνών, εργαζόμενος παράλληλα ως υποβοηθός στο Μικροβιολογικό Εργαστήριο του Γενικού Κρατικού Νοσοκομείου Αθηνών. Το 1947 έλαβε το πτυχίο της Ιατρικής και στη συνέχεια υπηρέτησε στο στρατό ως αξιωματικός του Υγειονομικού επί 42 μήνες, προαγόμενος μέχρι το βαθμό του επιάτρου και τιμώμενος επ' ανδρεία με το μετάλλιο εξαιρέτων πράξεων. Κατά τη διάρκεια της θητείας του υπηρέτησε στα Μικροβιολογικά Εργαστήρια των 401 και 430 Στρατιωτικών Νοσοκομείων. Το 1951 διορίστηκε ως επιστημονικός συνεργάτης του Εργαστηρίου Μικροβιολογίας του Πανεπιστημίου Αθηνών και ως εσωτερικός βοηθός του Μικροβιολογικού Εργαστηρίου του Νοσοκομείου του "Ελληνικού Ερυθρού Σταυρού". Το 1953 έλαβε την ειδικότητα της Μικροβιολογίας και το 1954 μετέβη για μετεκπαίδευση με υποτροφία της W.H.O. στο Εργαστήριο Αναφοράς Ιών του Λονδίνου. Στη συνέχεια εργάστηκε ως εσωτερικός βοηθός του Εργαστηρίου Clinical Pathology του Νοσοκομείου Bury - Manchester. Το 1955 οργάνωσε το πρώτο στην Ελλάδα ειδικό κέντρο μελέτης των ιώσεων και απέκτησε τον τίτλο του άμισθου Επιμελητού. Το 1956 αναγορεύτηκε διδάκτορας της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών με θέμα διατριβής "Προς διαπίστωση των ειδικών αντισωμάτων έναντι των ιών γρίππης Α και Β στον ελληνικό πληθυσμό". Την περίοδο 1955-1965 εργάστηκε ως Διευθυντής του Μικροβιολογικού Εργαστηρίου του Νοσοκομειακού Ιδρύματος Εργατών Θαλάσσης. Στα μεσοδιαστήματα της περιόδου αυτής, κατά το 1958-1959, μετέβη με υποτροφία του Ι.Κ.Υ. για μετεκπαίδευση στο Staatens Serum Institut της Κοπεγχάγης, όπου ασχολήθηκε με την παρασκευή εμβολίου κατά της πολιομυελίτιδος, ενώ το 1961 συμμετείχε στην Πράγα σε συνάντηση της W.H.O., η οποία είχε ως αντικείμενο την καταπολέμηση της πολιομυελίτιδος. Την περίοδο 1965-1967 εργάστηκε ως Διευθυντής του Μικροβιολογικού Εργαστηρίου του Θεραπευτηρίου Ι.Κ.Α. Πεντέλης. Το 1962 αναγορεύτηκε Υφηγητής της Ιατρικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών με θέμα υφηγεσίας "Πειραματικαί και ορολογικαί έρευναι προς προσδιορισμόν της αντιγονικής ικανότητας των αντιπολιομυελιτικών εμβολίων". Το 1967 εξελέγη Τακτικός Καθηγητής Μικροβιολογίας της Ιατρικής Σχολής του Α.Π.Θ., στην οποία υπηρέτησε επί 23 συναπτά χρόνια διευθύνοντας το Εργαστήριο Μικροβιολογίας της Σχολής και παράλληλα το Εργαστήριο Μικροβιολογίας του Νοσοκομείου ΑΧΕΠΑ. O Ι. Παπαπαναγιώτου κατά τη διάρκεια της Καθηγεσίας του διατέλεσε Συγκλητικός, Κοσμήτορας της Σχολής την περίοδο το 1976-1977 και Διευθυντής του Τομέα Βιολογικών Επιστημών και Προληπτικής Ιατρικής την περίοδο το 1987-1989. Ασχολήθηκε συστηματικά με την προπτυχιακή εκπαίδευση των φοιτητών της Ιατρικής, Oδοντιατρικής και Φαρμακευτικής του Α.Π.Θ., αλλά και με την μεταπτυχιακή εκπαίδευση των Μικροβιολόγων. Η δεινότητά του ως εκπαιδευτού και η ερευνητική παραγωγή του κατοπτρίζεται σε 4 επί υφηγεσία και σε 13 διδακτορικές διατριβές, οι οποίες εκπονήθηκαν από συνεργάτες του, ενώ το σύγγραμμά του "Ιατρική Μικροβιολογία και Ανοσολογία" θεωρείται κλασικό και επί σειρά ετών επανεκδιδόμενο αποτελεί πηγή εκσυγχρονισμένης γνώσης τόσο για τους Μικροβιολόγους, όσο και για τους κλινικούς γιατρούς. O Ι. Παπαπαναγιώτου ασχολήθηκε ερευνητικά με όλους τους τομείς της μικροβιολογίας και ιδιαίτερα με την εργαστηριακή διαγνωστική ιολογία, επικεντρώνοντας το ενδιαφέρον του στη γρίππη, στην πολιομυελίτιδα, στις ηπατίτιδες, στη μεγαλοκυτταρική ίωση, στην απομόνωση στελέχους Legionella, στο AIDS κ.ά. Είναι μέλος της "Society for Applied Bacteriology", της "Society for General Microbiology", της "International Association of Biological Standardization", της "New York Academy of Sciences", της "Ιατρικής Εταιρείας Αθηνών", της "Ελληνικής Μικροβιολογικής Εταιρείας" στην οποία διετέλεσε Γενικός Γραμματέας και Αντιπρόεδρος του Δ.Σ., της "Μικροβιολογικής Εταιρείας Θεσσαλονίκης" στην οποία διετέλεσε Πρόεδρος του Δ.Σ. από την ίδρυσή της το 1982 μέχρι το 1997, της "Ιατρικής Εταιρείας Θεσσαλονίκης" της οποίας διετέλεσε Πρόεδρος του Δ.Σ. κατά την περίοδο 1975-1976 και άλλων. O Ι. Παπαπαναγιώτου διετέλεσε επίσης Πρόεδρος της Κεντρικής Επιτροπής Νοσοκομειακών Λοιμώξεων του Υπουργείου Υγείας (1983-1999), Πρόεδρος του Δ.Σ. του Π.Γ.Ν.Θ. "ΑΧΕΠΑ" (1975-1982 και 1989-1993), Αντιπρόεδρος του Δ.Σ. του Κέντρου Ειδικών Λοιμώξεων (1992-1995), Μέλος του Ελληνικού Ινστιτούτου Pasteur (1976-1982) και της Επιστημονικής Επιτροπής του. Το 1990, ένα χρόνο περίπου μετά τη συνταξιοδότησή του ονομάστηκε Oμότιμος Καθηγητής του Α.Π.Θ. και το 1999 τιμήθηκε αναγορευόμενος ως Επίτιμος Πρόεδρος της "Εταιρείας Ιατρικής Βιοπαθολογίας Βορείου Ελλάδος". Η ευρύτατη αναγνώριση του εκπαιδευτικού, ερευνητικού και οργανωτικού έργου του Ι. Παπαπαναγιώτου, σε συνάρτηση με το διακεκριμένο ήθος του τον οδήγησαν το 1992 στην παμψηφεί εκλογή του ως Αντεπιστέλλοντος Μέλους εκ του εσωτερικού της Ακαδημίας Αθηνών.