Γεννήθηκε στις 29 Μαρτίου του 1782 στην Τήνο στο χωριό Κρόκος (από το ομώνυμο φυτό) και ήταν γιος του επίσης γιατρού Νατάλλη Ζαλλώνη, καθολικού στο δόγμα. Έφυγε σε νεαρή ηλικία από την Τήνο και εγκαταστάθηκε στη Σμύρνη. Αργότερα πήγε στο Παρίσι όπου σπούδασε ιατρική. Με την μελέτη του Ταξίδιον εις την Τήνον αναγορεύτηκε διδάκτορας. Το 1810 εγκατέλειψε το Παρίσι και πήγε στο στρατόπεδο της Σούμλας ως επικεφαλής ιατρός του Μεγάλου Βεζίρη Γιουσούφ. Μετά την αντικατάσταση του Μεγάλου Βεζίρη εγκαταστάθηκε μόνιμα στην Κωνσταντινούπολη όπου ιδιώτευσε ως γιατρός.